class: center, middle, inverse, title-slide # Ecologia Numérica ## Noções básicas de análise de comunidades biológicas ### Felipe Melo ### Laboratório de Ecologia Aplicada - UFPE ### 2022-01-31 --- # O que precisamos saber sobre análises de comunidades biológicas .pull-left[ - Entender como amostrar uma comunidade biológica - Saber identificar unidades amostrais, medidas e variáveis - Entender quais sãos as medidas básicas de uma comunidade biológica ] .pull-right[ <img src="https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/5/51/BorneoRainforest_DSC_9267.JPG" width="600" height="420" /> ] --- # Vocẽ é capaz de interpretar esses dados/gráfico? .panelset[ .panel[.panel-name[Matriz de dados] ``` ## # A tibble: 10 × 5 ## spec sample_1 sample_2 sample_3 sample_4 ## <chr> <int> <dbl> <int> <int> ## 1 sp1 0 2 1 1 ## 2 sp2 1 5 0 1 ## 3 sp3 0 0 4 0 ## 4 sp4 0 9 2 2 ## 5 sp5 0 1 1 2 ## 6 sp6 1 7 3 2 ## 7 sp7 0 1 0 0 ## 8 sp8 1 8 4 2 ## 9 sp9 1 1 4 1 ## 10 sp10 1 0 0 0 ``` ] .panel[.panel-name[Resultado 1] ``` ## Carregando pacotes exigidos: permute ``` ``` ## Carregando pacotes exigidos: lattice ``` ``` ## This is vegan 2.5-7 ``` ``` ## Warning in cor(x > 0): o desvio padrão é zero ``` ``` ## Species Accumulation Curve ## Accumulation method: exact ## Call: specaccum(comm = t(comm[, -1])) ## ## ## Sites 1.000000 2.0 3.000000 4 ## Richness 6.750000 8.5 9.250000 10 ## sd 1.089725 0.5 0.433013 0 ``` ] .panel[.panel-name[Gráfico 1] <img src="slide_experimento_files/figure-html/unnamed-chunk-4-1.png" width="450px" /> ] ] --- #Comunidades biológicas são entidades arbitrárias .center[ <img src=https://www.researchgate.net/profile/Benjamin-Bergen/publication/308967379/figure/fig1/AS:415559377276929@1476088484383/Scheme-of-alpha-colours-beta-black-dotted-line-and-gamma-grey-diversity-from.png>] --- #Comunidades biológicas são entidades arbitrárias .center[ <img src=https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/a/a4/Biodiversity.png/1200px-Biodiversity.png>] --- # Desenho amostral/experimental --- # O problema das amostras .center[ <img src=image026.gif width = 600>] fonte: [Sampling and Experimental Design in Community Ecology](http://ordination.okstate.edu/sampling.htm) --- # Amostras aleatórias .pull-left[ <img src=image027.gif> fonte: [Sampling and Experimental Design in Community Ecology](http://ordination.okstate.edu/sampling.htm)] .pull-right[ ### - Todos os pontos de amostra tem a mesma chance de serem escolhidos ### - Amostras podem não ser espacilamente independentes ###- São excelentes para estudos de biogeografia ] --- # Amostras aleatórias estratificadas .pull-left[ <img src=image035.gif> fonte: [Sampling and Experimental Design in Community Ecology](http://ordination.okstate.edu/sampling.htm)] .pull-right[ ### - Controla para amostrar aleatoriamente em função da heterogeneidade ### - Amostras podem não ser espacilamente independentes ### - São excelentes para estudos de biogeografia ] --- # Amostras uniformemente distribuídas .pull-left[ <img src=image036.gif> fonte: [Sampling and Experimental Design in Community Ecology](http://ordination.okstate.edu/sampling.htm)] .pull-right[ ### - Uniformdidade não é aleatoriedade e pode conter vieses ### - Amostras SÃO espacilamente independentes ] --- # Vejamos com o R .panelset[.panel[.panel-name[Aleatórios] ![](slide_experimento_files/figure-html/unnamed-chunk-6-1.png)<!-- --> ] .panel[.panel-name[Uniformes] ![](slide_experimento_files/figure-html/unnamed-chunk-7-1.png)<!-- --> ] .panel[.panel-name[Agrupados] ![](slide_experimento_files/figure-html/unnamed-chunk-8-1.png)<!-- --> ] ] --- # O problema da escala .pull-left[ <img src=http://ordination.okstate.edu/sampling_files/image039.gif> fonte: [Sampling and Experimental Design in Community Ecology](http://ordination.okstate.edu/sampling.htm)] .pull-right[ ## Vamos ver o que podemos aprender com essa figura... ##- ##- ] --- class: center, middle # FIM